Назад
Цели
Качественные результаты RT-ПЦР в реальном времени SARS-CoV-2 используются для первичной диагностики и последующего наблюдения за пациентами Covid-19 и бессимптомными носителями вируса. Тем не менее, политика принятия клинических решений и управления здравоохранением часто дополнительно основывается на пороговых значениях цикла (Ct) (т.е. на количественных результатах) для руководства уходом за пациентами. Поэтому для оценки сопоставимости количественных результатов необходим анализ межпротокольной вариабельности.
Методы
Были проанализированы значения Ct, сообщаемые при внешней оценке качества детектирования генома вируса SARS-CoV-2. Три положительных и два отрицательных образца были распределены между участвующими тестовыми лабораториями. Были оценены качественные результаты (положительные/отрицательные) и количественные результаты (значения Ct).
Результаты
В общей сложности в исследовании приняли участие 66 лабораторий, которые предоставили результаты 101 тест системы и сообщили значения Ct для в общей сложности 92 различных протоколов. Во всех трех положительных пробах значения Ct для E-, N-, S-, RdRp- и ORF1ab-генов варьировали менее чем в двух циклах. Однако 7,7% зарегистрированных результатов отклонялись более чем на ±4,0 (максимум 18,0) циклов от соответствующих индивидуальных значений. Эти более значительные отклонения, по-видимому, являются систематическими ошибками.
Выводы
В попытке использовать ПЦР-диагностику, выходящую за рамки идентификации инфицированных лиц, лабораториям часто предлагается сообщать значения Ct вместе с качественным результатом. Данное исследование подчеркивает ограничения интерпретации значений Ct из различных протоколов детектирования генома SARS-CoV и предполагает необходимость стандартизации отчетности о значениях Ct в отношении гена-мишени.
Оригинальная статья: https://www.degruyter.com/view...
